拥有“平成鲁邦”之称的怪盗基德，无论防备多么严密的钻石珠宝对他来说都易如反掌。他一直是中森银三等警官的梦魇，而关于他的身份却始终是个谜。某高中二年级学生黑羽快斗，是一个出身于魔术世家的俊朗男孩，他与青梅竹马的女孩中森青子终日打情骂俏，乐在其中，也由此惹出了诸多的麻烦。偶然机会，他在父亲黑羽盗一的画像后面发现一间密室，在这里不仅发现了各种精密的设备，也发现8年前因事故去世的父亲竟和基德有着千丝万缕的关系。数日后，消失多年的怪盗基德发出预告，将要盗取东京市美术馆的宝石月之瞳。警察与盗贼新的战争就此展开……

喜欢魔术的高中生黑羽快斗。父亲是天才魔术师，但也有世界大盗怪盗基德这一不为人知的一面。然而，他的父亲因魔术中的意外事故而去世了。自那8年后，快斗意外得知了父亲背后的一面，怀疑他非因事故而死，而是被什么人所杀害的。为了解除这个疑惑，快斗身着礼帽和白色斗篷，继承了父亲的轨迹，成为了怪盗基德。

故事的主人公是喜欢魔法的高中生黑羽快斗，他的父亲是在8年前因事故而死亡的大魔法师——黑羽盗一。某日，他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服，于是他打算会见基德。在那里，他遇到了父亲过去的同伴——寺井，并得知父亲就是怪盗基德，而且死因不是事故死而是他杀。于是，快斗为查出杀害父亲的犯人，而自己成为了基德。

消失8年，如今突然重出江湖的神秘怪盗——怪盗基德，引起了喜爱魔术表演的高中生黑羽快斗的注意，因为他父亲——世界知名魔术师黑羽盗一也是8年前去世的。快斗在阴差阳错之下，进入到父亲的密室，发现其中存放着与怪盗基德一模一样的服装。疑惑的快斗决定穿上基德服装，去今晚基德的预告现场去一探究竟……快斗发现以基德身份活动的人竟然是盗一生前的魔术助手寺井黄之助，他更从寺井口中得知父亲黑羽盗一就是怪盗基德，以及盗一其实是遭暗杀身亡的真相……快斗决定继承父亲的衣钵，成为第二代怪盗基德，以此引出杀父元凶，调查父亲的死因。