《倚天屠龙记之九阳神功》讲述了武当派张翠山之子张无忌无意中卷入屠龙刀而起的江湖纷争之中，因缘际会练就一身盖世武功，主要是明教和中原武林之争及起义军和腐朽朝廷之间的对抗。

相传屠龙刀与倚天剑内藏有大秘密，得之者可雄霸天下，掀起无数腥风血雨…武当弟子张翠山，爱上明教魔女殷素素，为世人不容，夫妻二人与义兄谢逊远赴世外桃源冰火岛避世，并生下儿子张无忌。武林五大派被神秘势力挑拨，上武当逼迫父亲二人交出魔教谢逊，张翠山殷素素被逼双双去世。眨眼十年，武林再起波澜，张无忌远赴光明顶，出手连败六大派高手，担任明教教主。汝阳王之女赵敏郡主设下的圈套圈禁六大派众人，无忌赴赵敏大都之约将其全部救下，大都一行张无忌与赵敏暗生情愫，与此同时峨眉弟子周芷若解开屠龙刀倚天剑的秘密，练成九阴白骨爪，并陷害赵敏。忠心跟随的小昭、青梅竹马周芷若、相爱相杀的赵敏，张无忌周旋在三人中究竟会如何选择…